近日，澳门金沙娱乐城
在徐汇校区商澳门金沙娱乐城
大楼206举行第四十八期“药苑讲坛”。本期讲坛邀请南开大学副研究员付浩浩为澳门金沙娱乐城
师生作题为“分子模拟增强采样与自由能计算方法在药物设计中的平台化应用”的学术报告。报告会由澳门金沙娱乐城
教授徐志建主持，澳门金沙娱乐城
相关研究领域师生参与。
付浩浩是“百名青年学科带头人”，主要研究方向为分子模拟增强采样算法、蛋白-配体结合自由能计算以及人工智能在化学中的应用。他所提出的增强采样算法在NAMD、Gromacs、LAMMPS等多款国际知名分子模拟软件中实现。开源发布了蛋白质-配体结合自由能计算软件BFEE，全平台下载量超过17万次。在Nature Computational Science、Nature Protocols、Account of Chemical Research、PNAS、JACS等期刊上发表一作或通讯作者论文40余篇，Google学术引用3000余次，h-index 25。自由能计算方法和应用的相关工作被ACS c&en和Science网站专题报道。
付浩浩在报告中指出，在药物研发过程中，精确预测小分子与靶标蛋白的结合自由能是理性药物设计的核心环节。然而，传统的分子动力学模拟受限于时间尺度，往往难以跨越较高的能量壁垒，导致采样不充分。为挖掘先进计算模拟技术在加速药物发现中的潜力，团队建立了基于机器学习的增强采样方法，能够从复杂的分子轨迹信号中高效学习反应坐标（CVs），实现了对多稳态体系的高效探索。此外，团队还开发了几何路径与炼金术（alchemy）相结合的自由能计算策略，通过分步处理平移、旋转及拓扑变化，显著提高了结合自由能计算的精度与效率，相关算法已形成具有自主知识产权的平台化应用工具，在解析复杂生物大分子互作机制及先导化合物优化等方面成果丰硕。
交流互动环节，师生围绕报告内容踊跃提问，付浩浩逐一进行了细致解答。此次“药苑讲坛”不仅为与会师生带来了计算驱动药物设计的前沿动态，更为科研团队在方法学开发和虚拟筛选平台建设方面提供了新思路。
